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Zu Ihrem Problem:
Ich weiß nicht, was die Beschädigung Ihrer Systemdateien verursacht hat, deshalb kann ich Ihnen auch keinen konkreten Hinweis geben, wie das zu verhindern ist. Aber erfahrungsgemäß schleichen sich mit der Zeit durch die Installation und Deinstallation von Programmen, fehlerhafte Downloads, inkompatible Dateiversionen, gescheiterte und erneut installierte Updates usw. solche Fehler ein. Falls Windows 7 ernsthafte Ausfallerscheinungen zeigt, hilft dann eine Reparaturinstallation.
Oft genug sind Tuning-Programme, automatische Treiber-Updater und ähnliche Schlangenöl-Programme ebenfalls für solche Probleme verantwortlich.
Das Beste für ein sauberes und stabiles System ist, eine "Programm-Diät" einzuhalten und nur die Programme zu installieren, die man wirklich jeden Tag braucht. Das sind in der Regel nur eine Handvoll: Office, E-Mail, Browser, Skype, Bildbearbeitung.
Um Ihren PC wieder schneller zu machen, sollten Sie also zunächst einmal sämtliche nicht mehr von Ihnen benötigten Programme und Tools deinstallieren. Damit entfernen Sie alle überflüssigen Autostart-Einträge, Dienste, Hintergrundprogramme, die das System belasten.
Nutzen Sie ein Tuning-Programm wie TuneUp o.Ä.? Dann machen Sie dessen Einstellungen rückgängig und deinstallieren es über die Systemsteuerung.
Durchforsten Sie zudem mit dem Tool msconfig die Autostart-Programme Ihres Systems und deaktivieren Sie dort alle nicht erforderlichen Einträge. Mit Ausnahme Ihres Sicherheitsprogramms sind nur sehr wenige Programme im Autostart nötig: Sicherheitskritische Updater für Java, Flash und Co., eventuell ein Cloudprogramm oder die Software zur Synchronisierung Ihres Smartphones. Alles andere können Sie beruhigt deaktivieren.
Viele Grüße,
Martin Koch